大橙子网站建设,新征程启航
为企业提供网站建设、域名注册、服务器等服务
cat:从第一行开始显示文本内容(适用于内容较少的)
创新互联公司是专业的阜新网站建设公司,阜新接单;提供网站制作、成都做网站,网页设计,网站设计,建网站,PHP网站建设等专业做网站服务;采用PHP框架,可快速的进行阜新网站开发网页制作和功能扩展;专业做搜索引擎喜爱的网站,专业的做网站团队,希望更多企业前来合作!
tac:从最后一行开始显示,是 cat 的逆顺序
more:一页一页的显示文本内容(适用于内容较多的)
less:与 more 类似,但是比 more 更好的是,它可以往前翻页!
head:只看文本的前面几行
tail:只看文本的后面几行
nl:显示文本内容与行号
常用的7个Linux文件内容查看命令:
1.cat由第一行开始显示文件内容
用法:
cat-A 相当于-vET的整合选项,可列出一些特殊字符而不是空白;
cat-b 列出行号,仅针对非空白行做行号显示,空白行不标行号;
cat-E 将结尾的断行字节$显示出来;
cat-n 列印出行号,连同空白行也会有行号,与-b的选项不同;
cat-T 将[tab]按键以^I显示出来;
cat-v 列出一些看不出来的特殊字符;
2.tac 由最后一行开始显示文件内容
tac-b 在行前而非行尾添加分隔标志;
tac-r 将分隔标志视作正则表达式来解析;
tac-s 使用指定字符串代替换行作为分隔标志;
3.nl 显示行号
nl-b a 无论是否为空行,均列出行号;
nl-b t 空行不列出行号;
nl-n ln 行号在荧幕的最左方显示;
nl-n rn 行号在自己栏位的最右方显示,且不加0;
nl-n rz 行号在自己栏位的最右方显示,且加0;
nl-w 行号栏位的占用的位数;
4.more 一页一页的显示文件内容
在more程序运行过程中,可以按以下键:
空白键(space):代表向下翻一页;
Enter:代表向下翻『一行』;
/字串:代表在这个显示的内容当中,向下搜寻『字串』这个关键字;
:f:立刻显示出档名以及目前显示的行数;
q:代表立刻离开more,不再显示该文件内容。
b或[ctrl]-b:代表往回翻页,不过这动作只对文件有用,对管线无用。
5.less与more类似,但是比more更好的是,他可以往前翻页
less运行时可以输入的命令有:
空白键:向下翻动一页;
[pagedown]:向下翻动一页;
[pageup]:向上翻动一页;
/字串:向下搜寻『字串』的功能;
?字串:向上搜寻『字串』的功能;
n:重复前一个搜寻(与/或?有关!);
N:反向的重复前一个搜寻(与/或?有关!);
q:离开less这个程序;
6.head 显示前几行
语法:
head-n 后面接数字,代表显示行数;
7.tail 显示后几行
tail-n 后面接数字,代表显示行数;
tail-f 表示持续侦测后面所接的档名,要等到按下[ctrl]-c才会结束tail的侦测;
在命令行里显示文本文件内容:
cat:在命令行里显示文本文件内容,可以滚屏的(但是不方便把内容输出到其他文件,所以一般脚本内部都用cat,less可以在调用脚本的时候用)。
less:在命令行里编辑文本文件。
vi:在图形界面打开文本文件。
gedit,kate等等:在图形界面打开任意文件或者url(gnome)。
命令作用
grep、fgrep和egrep命令这组命令以指定模式搜索文件,并通知用户在什么文件中搜索到与指定的模式匹配的字符串,并打印出所有包含该字符串的文本行,在该文本行的最前面是该行所在的文件名。grep命令一次只能搜索一个指定的模式;egrep命令检索扩展的正则表达式(包括表达式组和可选项);fgrep命令检索固定字符串,它不识别正则表达式,是快速搜索命令。
在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令:
通过多敲键盘,形成手感 肌肉记忆 ,熟练掌握这些命令,在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍(主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记)
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来:
参数的用法介绍:
注意事项:
用 cat 命令可以 查看文本 ,也可以 编辑文本 ,编辑文本要加 符号,退出时,另起一行,按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件,tac逆向查看
结合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行,默认 10 行 (在R语言里head和tail默认是前6行)。
less命令用得最多 ,more命令用得比较少
3.1 less命令
less [参数] 文件名
less命令重要的补充用法1 :
需要注意 退出 :只要使用less命令, 按q键
less命令重要的补充用法2 :
参数用法:
less命令 不加参数 查看文件:
less命令加 -N参数 查看文件:显示行号
less命令加 -S参数 查看文件:单行显示,非常规整
对比:less和cat命令显示文本行号的用法:less -N,cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看,按空格翻页,按回车换行 ,more命令一般很少用,熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去,但是别的命令不一定会把换行符算进去,。
常见参数:
切记:用less命令,按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前:
排列后:
解释:1和0比,1大;7和0比,7大…在sort字典排序里,100816比1737小,所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时,因为制表符对齐的原因,出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样,所以 加上-n参数 , 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重,只有两行出现重复,而且是相邻的两行,如果不相邻,即使出现两行一模一样,不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之,uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1:
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯,原始数据不要轻易修改,修改的东西另外保存,文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ,然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上,将空格替换成制表符
补充小知识 :
清屏 :control L
查看历史(输入过的)命令 :history