大橙子网站建设,新征程启航
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ubuntu进不去root,貌似是每次开机时默认root密码都会产生一个新的。
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2. apt-get install r-base
3. apt-get install r-base-dev
4. 安装成功。
5. 安装Rstudio
下载安装包安装
下载 R-3.2.2.tar.gz
解压:
tar
-zvxf
R-2.13.0.tar.gz
配置:
cd
R-2.13.0
./configure
--prefix=/home/xxx/R
--enable-R-shlib
prefix设置R的安装路径,enable-R-shlib可以保证lib目录下的动态库能够共享
如果提示G77错误
sudo
apt-get
install
build-essential
sudo
apt-get
install
gfortran
如果提示错误:configure:error:--with-readline=yes(default)...
sudo
apt-get
install
libreadline6-dev
如果提示错误:configure:error:--with-x=yes(default) and X11...
sudo
apt-get
install
libxt-dev
安装:
make
make
install
link到bin目录下:
cd
/bin
sudo
ln
-sv
/home/xxx/R/bin/R
至此安装完毕。
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安装pkg:
终端下输入:R
source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()
默认将安装一下几个包
affy affydata affyPLM
annaffy annotate Biobase
Biostrings DynDoc gcrma
genefilter geneplotter hgu95av2
limma marray matchprobes
multtest ROC vsn
xtable affyQCReport
如果需要Bioconductor上别的包的话,可以使用
biocLite(c("pkg1", "pkg2"))
如:
biocLite(c("copula",
"pspline"))
安装CRAN上的包
install.packages(c("pkg1",
"pkg2"))
来安装(pkg1和pkg2为需要安装的包)。
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编辑器:
1.直接shell。终端输入R,就进入R命令行了。
2.安装GUI:Rcmdr
sudo
apt-get
install
r-cran-rodbc
sudo
apt-get
install
r-cran-rcmdr
运行R后,library(Rcmdr)就可以打开图形界面。
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