大橙子网站建设,新征程启航
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本篇文章为大家展示了R语言ggplot2怎样画带有空白格的热图,内容简明扼要并且容易理解,绝对能使你眼前一亮,通过这篇文章的详细介绍希望你能有所收获。
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之前有人在公众号留言问文章开头这幅图如何实现,下面的B图是折线图加柱形图,相对比较容易实现,上面的A图稍微有点复杂,我想到的办法是拼图,图A可以看成三个热图,然后加一个堆积柱形图,最后将四个图组合到一起。那就按照这个思路试一下看能不能实现。
这个热图和常规的还稍微有点不太一样,可以简单的理解为带有缺失值的热图,缺失值是空白格,其他值分别填充颜色。
那我们就按照这个思路来构造数据
将数据集按照以上格式整理好,存储在csv文件中。
df<-read.csv("example_data/ggplot2_heatmap.csv",header=T)
df1<-reshape2::melt(df)
library(ggplot2)
ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
geom_tile(aes(fill=value),color="black")+
theme(panel.background = element_blank())
df1$value1<-ifelse(is.na(df1$value),0,df1$value)
df1$value1<-as.factor(df1$value1)
summary(df1)
ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
geom_tile(aes(fill=value1),color="black")+
scale_fill_manual(values = c("white","red","red2","red4"))+
theme(panel.background = element_blank())
这样是不是和文章开头提到的图有点像了。
df1$A<-factor(df1$A,levels = rev(df$A))
ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
geom_tile(aes(fill=value1),color="black")+
scale_fill_manual(values = c("white","red","red2","red4"))+
theme(panel.background = element_blank())
ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
geom_tile(aes(fill=value1),color="black")+
scale_fill_manual(values = c("white","orangered","red2","red4"))+
scale_x_discrete(position = "top")+
theme(panel.background = element_blank(),
axis.title = element_blank(),
axis.ticks = element_blank(),
axis.text.x.top = element_text(angle = 90,
hjust = 0,
vjust= 0.5),
plot.title = element_text(hjust=0.5),
legend.position = "none")+
labs(title = "Plant growth and development")
ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
geom_tile(aes(fill=value1),color="black")+
scale_fill_manual(values = c("white","orangered","red2","red4"))+
scale_x_discrete(position = "top")+
theme(panel.background = element_blank(),
axis.title = element_blank(),
axis.ticks = element_blank(),
axis.text.x.top = element_text(angle = 90,
hjust = 0,
vjust= 0.5),
plot.title = element_text(hjust=0.5),
legend.position = "none")+
labs(title = "Plant growth and development")+
geom_text(aes(label=value1,color=value1))+
scale_color_manual(values = c("white","black","black","black"))
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